0573-83108883
021-6766-9183
允英學(xué)術(shù)簡報(bào):DNAplus?與AllNGS?雙星閃耀 | 成功鑒定肺癌患者胸水樣本中分子標(biāo)記特征
發(fā)布時間: 2021-12-17 14:24:13

    肺癌是最常見的和致死率最高的惡性腫瘤疾病,中國2020年新發(fā)肺癌病例82萬人,死亡病例71萬,其中約80-85%為非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者。多達(dá)50-70%的NSCLC患者診斷即晚期,且不滿足手術(shù)條件,因此很難獲取足夠數(shù)量的腫瘤組織進(jìn)行基因檢測,定制個體化靶向用藥方案

    允英醫(yī)療攜手常州二院,充分利用自己的核心技術(shù)優(yōu)勢,積極探索肺癌患者替代組織基因檢測的液體活檢方案。本研究入組了108名肺癌患者,采集了患者的惡性胸腔積液(malignant pleural effusion,MPE)作為樣本,利用允英自研的高效游離DNA提取技術(shù)DNAplus?提取樣本中的游離DNA(cell-free DNA,cfDNA),并基于高效液相雜交捕獲的允英AllNGS?技術(shù)構(gòu)建測序文庫并進(jìn)行高通量測序,尋找腫瘤分子特征標(biāo)記物與臨床用藥靶點(diǎn)。

    結(jié)果顯示,允英AllNGS?技術(shù)的測序數(shù)據(jù)覆蓋度接近100%,平均深度約3492×,性能是同類研究結(jié)果的10倍。測得突變位點(diǎn)依據(jù)臨床用藥意義是否明確被分為兩組,研究利用ARMS-PCR(amplification refractory mutation system)技術(shù)對頻率在1-10%的突變進(jìn)行了成功驗(yàn)證(圖1)。


        圖1 AllNGS?在108例肺癌患者M(jìn)PE樣本中檢測結(jié)果
    本研究發(fā)現(xiàn),108名患者的MPE樣本中僅檢測到2例(1.9%)存在ERBB2 M774_A775insAYVM突變,該突變表現(xiàn)出對曲妥珠單抗(Herceptin)等藥物的敏感性;而83例(76.8%)患者存在意義不明的ERBB2突變。同時,在93例(86%)患者中檢出EGFR突變,其中62名患者(66.7%)的EGFR突變與靶向藥物(如吉非替尼,阿法替尼,奧西替尼等)敏感性相關(guān);其余31名患者(33.3%)未觀察到可靶向用藥的突變。另有15名患者為野生型EGFR(圖2),其余諸如ALK-EML4融合(6例,5.6%)等多種靶向用藥相關(guān)突變均有檢出。

         圖2 108例肺癌患者M(jìn)PE樣本中EGFR突變檢測結(jié)果

    此外,本研究還發(fā)現(xiàn),部分突變頻率不僅存在性別差異,還與年齡強(qiáng)相關(guān)。ERBB2、PIK3CA、BRAF、KRAS及EGFR 21號外顯子與18號外顯子等用藥相關(guān)突變頻率均隨年齡增長而增加;而EGFR 20號外顯子、ROS1融合等用藥相關(guān)突變的頻率則隨著年齡增長而降低(圖3)。

         圖3 108例肺癌患者M(jìn)PE樣本中基因突變頻率與年齡分布
    綜上,本研究不僅揭示了晚期肺癌患者的基因突變特征,也明確了惡性胸腔積液樣本是一種可靠的液體活檢替代樣本,能夠?yàn)椴粷M足組織取材臨床條件的肺癌患者提供基因檢測與用藥參考。


允英勵行,讓生命更健康!
  • 地址:上海市松江區(qū)莘磚公路518號漕河涇開發(fā)區(qū)9號樓
    浙江省嘉興市南湖區(qū)凌公塘路3556號5號樓
  • 郵箱:service@yymedicine.com
  • 電話:021-67669183、0573-83108883