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允英學術(shù)簡報:DNAplus?與AllNGS?初出茅廬 | 高效提取血液游離DNA分子,助力非小細胞肺癌患者液體活檢
發(fā)布時間: 2021-12-20 17:12:56

    表皮生長因子受體酪氨酸激酶抑制劑(epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs)能夠有效提升非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的生存期與生活質(zhì)量,但其療效依賴于對患者個體EGFR基因突變的精準鑒定。然而,腫瘤組織樣本并不是總能順利獲取,且組織樣本中存在的腫瘤異質(zhì)性,導致其不能完全滿足臨床基因檢測需求;但基于血液樣本的液體活檢技術(shù)受限于血液中循環(huán)腫瘤DNA分子(circulating tumor DNA,ctDNA)的高度片段化與低豐度特點,其檢測靈敏度極為有限。

    允英醫(yī)療聯(lián)手上海胸科醫(yī)院,入組79名NSCLC患者,并同時收集了患者經(jīng)福爾馬林固定后石蠟包埋的組織樣本與配對血液樣本,借助高效游離DNA提取的允英DNAplus?技術(shù)與高效液相雜交捕獲的允英AllNGS?技術(shù),研究對比了血液樣本與組織樣本中EGFR突變檢測結(jié)果的一致性。

    研究發(fā)現(xiàn),允英DNAplus?與AllNGS?技術(shù)的聯(lián)合應用,能夠使血液中EGFR突變狀態(tài)檢測結(jié)果與組織檢測結(jié)果的總體一致性達到86.1%(68/79),敏感性達到72.7%(24/33),特異性高達95.7%(44/46)。而部分用藥相關(guān)突變?nèi)鏓19del,檢測敏感性達60.0%(12/20),特異性達100%(59/59),一致性達89.9%(71/79);L858R的檢測結(jié)果一致性更是高達97.5%(77/79),敏感性和特異性分別為91.7%(11/12)和98.5%(66/67)(圖1)。

        圖1 聯(lián)合技術(shù)對血液EGFR檢測結(jié)果與組織結(jié)果的對比
    本研究進一步對比了血液與組織樣本中NGS檢測結(jié)果,以及組織樣本中突變擴增系統(tǒng)PCR(amplification refractory mutation system,ARMS-PCR)檢測結(jié)果,三者的總體一致性也達到78.5%(62/79)(圖2)。


圖2 不同樣本、不同方法中檢測結(jié)果對比

    依據(jù)血漿和組織中的NGS檢測結(jié)果,本研究共確定28名患者接受了EGFR TKIs治療。至研究結(jié)束,所有患者均顯示部分緩解(partial response,PR)或疾病穩(wěn)定(stable disease, SD),中位無進展生存期(progress free survival,PFS)為10.8個月(95% CI 9.1-16.8)。

    綜上,本研究提示應用靶向捕獲測序技術(shù)檢測晚期NSCLC患者血漿ctDNA中的EGFR突變的可行性,表明檢測結(jié)果與組織檢測結(jié)果的相似性。并且,依據(jù)ctDNA測序結(jié)果確定有EGFR激活突變的28例患者的治療顯示,使用EGFR-TKIs治療可控制疾病進展,具有重要臨床意義。




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